Скачав архив, поинтересуйтесь, а не прилагается ли к нему патч с последними исправлениями? Версия патча обязательно должна совпадать с версией архива, иначе образуется каша и программа рухнет еще на стадии компиляции. Впрочем, это не правило, а скорее рекомендация. Это смотря какой патч и что он исправляет. Тем не менее, без необходимости лучше не рисковать.
Патчи бывают разных видов. Например, в случае с Рысем — это обыкновенный архив измененных файлов, который нужно просто взять и распаковать (с перезаписью) в основной каталог программы, и который по своему размеру вплотную приближается к дистрибутиву, что не есть хорошо, зато у пигвистов никаких вопросов не возникает.